Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc6a9P28571 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms