Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afxP27661 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2afxP27661 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afxP27661 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2afxP27661 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afxP27661 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afxP27661 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afxP27661 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms