Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou2f1P25425 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou2f1P25425 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou2f1P25425 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms