Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NdnP25233 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NdnP25233 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NdnP25233 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NdnP25233 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NdnP25233 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NdnP25233 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NdnP25233 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NdnP25233 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NdnP25233 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NdnP25233 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NdnP25233 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NdnP25233 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NdnP25233 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NdnP25233 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NdnP25233 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NdnP25233 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NdnP25233 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NdnP25233 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NdnP25233 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NdnP25233 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NdnP25233 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NdnP25233 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NdnP25233 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NdnP25233 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NdnP25233 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NdnP25233 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms