Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fcer1aP20489 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fcer1aP20489 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms