Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spi1P17433 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spi1P17433 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spi1P17433 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spi1P17433 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spi1P17433 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms