Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptbp1P17225 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptbp1P17225 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms