Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm1P12657 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms