Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt8P11679 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt8P11679 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt8P11679 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt8P11679 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt8P11679 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt8P11679 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt8P11679 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms