Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd4P10628 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd4P10628 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms