Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem254aP0DN89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem254aP0DN89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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