Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl3P09542 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl3P09542 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl3P09542 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl3P09542 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl3P09542 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl3P09542 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl3P09542 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myl3P09542 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1528.2 ms