Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01807 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01807 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01807 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01807 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01807 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01807 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01807 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01807 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01807 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01807 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01807 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01807 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P01807 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01807 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01807 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01807 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01807 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01807 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01807 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01807 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01807 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01807 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01807 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01807 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01807 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01807 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms