Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01739 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01739 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01739 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01739 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01739 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01739 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01739 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01739 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01739 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01739 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms