Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01679 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01679 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01679 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01679 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01679 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01679 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01679 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01679 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01679 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01679 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01679 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01679 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01679 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01679 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01679 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01679 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01679 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01679 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01679 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01679 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01679 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01679 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01679 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01679 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01679 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01679 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01679 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01679 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01679 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P01679 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01679 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P01679 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01679 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01679 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P01679 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01679 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms