Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01653 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01653 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01653 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01653 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01653 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01653 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01653 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01653 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01653 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01653 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01653 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01653 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01653 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01653 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01653 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01653 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01653 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01653 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01653 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01653 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms