Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lnx1O70263 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lnx1O70263 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lnx1O70263 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lnx1O70263 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lnx1O70263 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lnx1O70263 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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