Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad51dO55230 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad51dO55230 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms