Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Supt5hO55201 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Supt5hO55201 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Supt5hO55201 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Supt5hO55201 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms