Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bnc1O35914 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnc1O35914 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms