Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarb2O35114 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarb2O35114 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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