Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3aO08759 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3aO08759 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms