Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec22bO08547 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sec22bO08547 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sec22bO08547 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec22bO08547 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sec22bO08547 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec22bO08547 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22bO08547 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22bO08547 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22bO08547 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22bO08547 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec22bO08547 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sec22bO08547 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms