Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IfnabL7MTU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IfnabL7MTU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms