Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8720K9J7F4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8720K9J7F4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8720K9J7F4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8720K9J7F4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms