Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Gm19965J3QNY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm19965J3QNY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm19965J3QNY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm19965J3QNY8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Gm19965J3QNY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Gm19965J3QNY8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Gm19965J3QNY8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Gm19965J3QNY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Gm19965J3QNY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm19965J3QNY8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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