Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3336J3QMQ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3336J3QMQ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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