Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lipo1J3QME6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lipo1J3QME6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lipo1J3QME6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lipo1J3QME6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms