Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28051J3QMA2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms