Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfip1G5E8V9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms