Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hmgxb3G3X9M3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms