Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdh11xF6ZNL5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh11xF6ZNL5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms