Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm28305F6U473 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms