Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930451I11RikE9Q9R3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930451I11RikE9Q9R3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms