Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh18E9Q9Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms