Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DspE9Q557 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DspE9Q557 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DspE9Q557 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DspE9Q557 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DspE9Q557 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DspE9Q557 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DspE9Q557 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms