Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms