Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930426L09RikE9Q0N7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930426L09RikE9Q0N7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930426L09RikE9Q0N7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930426L09RikE9Q0N7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930426L09RikE9Q0N7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930426L09RikE9Q0N7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms