Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc62E9PVD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc62E9PVD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms