Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SafbD3YXK2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SafbD3YXK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SafbD3YXK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms