Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700015F17RikD3YUK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.7 ms