Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud7bB2RUR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud7bB2RUR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud7bB2RUR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms