Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprbB2RU80 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprbB2RU80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms