Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprsB0V2N1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprsB0V2N1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms