Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem238A9JSM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms