Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pramel3A2AHA7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel3A2AHA7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms