Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms