Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1lA2A5N3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms