Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ino80eA0A0U1RP99 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80eA0A0U1RP99 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms