Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf728Q6P5C7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf728Q6P5C7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf728Q6P5C7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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